Champoiseau, P., Daugrois, J.-H., Cociancich, S., Pieretti, I., Royer, M. et Rott, P. 2006. Towards identification of genes involved in pathogenicity of Xanthomonas albilineans, the pathogen causing sugarcane leaf scald. In: Abstracts of the 11th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. Du 10 au 14 Juillet 2006, Edinburgh, Grande-Bretagne.

Résumé: Contrairement à la plupart des bactéries phytopathogènes, aucun gène hrp ou avr n'a pu être mis en évidence chez Xanthomonas albilineans, l'agent causal de I'échaudure des feuilles de la canne à sucre. Cependant, cet agent pathogène produit une pathotoxine appelée albicidine qui est responsable des symptômes foliaires de la maladie. Récemment, tous les gènes impliqués dans la biosynthèse de I'albicidine chez la souche Xa23R1, originaire de Floride, ont été clonés et séquencés. La variation de ces gènes de biosynthèse n'a, cependant, pas pu être corrélée à une variation de pathogénie de X. albilineans. Au cours de notre étude, nous avons essayé d'identifier de nouveaux gènes impliqués dans la pathogénie de X. albilineans en utilisant différentes approches et 19 souches de l'agent pathogène variant dans leur capacité à coloniser la canne à sucre et à produire les symptômes de la maladie. La production d'albicidine in vitro a varié en fonction des souches de X. albilineans, mais elles avaient toutes le même profil RFLP (Polymorphisme de longueur des fragments de restriction) en utilisant les gènes de biosynthèse de I'albicidine comme sonde. De même, toutes les souches avaient le même profil génétique déterminé par électrophorèse en champ pulsé. En revanche, une variation entre souches a été mise en évidence par AFLP (Polymorphisme de longueur des fragments amplifiés) en utilisant 16 combinaisons d'amorces sélectives, après digestion de l'ADN génomique total avec Sacl and Mspl. Cependant, aucune relation entre cette variabilité génétique et la variabilité du pouvoir pathogène de X. albilineans n'a pu être identifiée. Une étude phylogénétique réalisée à partir des séquences des gènes de ménage ihfA et efp suggère que X. albilineans se trouve sur une voie d'évolution intermédiaire entre le groupe comprenant Xanthomonas campestris et Xylella fastidiosa, une autre bactérie phytopathogène du système vasculaire qui ne possède pas non plus les gènes hrp et avr. Le séquençage du génome complet de X. albilineans, qui est en cours au Génoscope à Evry, constitue une étape clé dans le décryptage de la pathogénie de cet agent pathogène de la canne à sucre (Résume d'auteur).